Хімічний склад, який використовується для обох систем, функціонально однаковий. Різниця між ними досить проста: HiSeq може генерувати на порядок більше зчитувань, ніж MiSeq (25 мільйонів проти 300 мільйонів), і, отже, займає на порядок більше часу (1 тиждень порівняно з 1 днем). 12 вересня 2014 р.
MiSeq може обробляти до 15 мільйонів зчитувань за прогін, що робить його ідеальним для проектів із обсягами вибірки порядку десятків і сотень. HiSeq: навпаки, HiSeq пропонує астрономічний стрибок у пропускній здатності, завдяки здатності генерувати мільярди зчитувань за один цикл.
iSeq можна використовувати лише для початкової та швидкої оцінки мікробіома. MiSeq краще підходить для детального аналізу відмінностей у складі мікробіоти.
Illumina MiSeq: MiSeq пропонує вищий максимальний вихід за цикл із більшою доступною довжиною зчитування, ніж MiniSeq, хоча час роботи MiSeq довший. Виберіть MiSeq для більшої гнучкості виведення або якщо спрощений робочий процес MiniSeq не є необхідним.
MiSeq — це інтегрований інструмент, який виконує клональну ампліфікацію, секвенування та аналіз даних (виклик основи, вирівнювання, виклик варіантів і звітування) за один прогін. Послідовне опитування баз дозволяє гнучко регулювати довжину зчитування під час циклу.
Центр підтримки: Систему HiSeq 3000 було знято з виробництва. Ilumina підтримуватиме інструмент і має намір постачати реагенти до 28 лютого 2023 року. Щоб знайти альтернативний інструмент, скористайтеся сторінкою порівняння платформ.