Існують величезні відмінності в тому, як різні працівники дивляться на концепцію виду. Деякі сприймають види як еволюційну лінію, деякі як фундаментальні одиниці біологічної організації, тоді як інші бачать у ньому засіб для захисту цілісності генофондів тощо.
Дискусія про концепції видів називається проблемою видів. Проблема була визнана навіть у 1859 році, коли Дарвін написав у «Про походження видів»: «Жодне визначення не задовольнило всіх натуралістів; проте кожен натураліст нечітко знає, що він має на увазі, коли говорить про вид.
Таким чином, основні обмеження концепції біологічних видів полягають у тому, що вона не має відношення до алопатричного видоутворення та незастосовна до: (1) викопних видів; (2) організми, що розмножуються безстатевим шляхом або з інтенсивним самозаплідненням; і (3) статеві організми з відкритою системою спаровування (види, які вільно гібридизуються).
Визначення виду як групи особин, що схрещуються між собою не можна легко застосувати до організмів, які розмножуються лише або переважно нестатевим шляхом. Також у природі багато рослин і деякі тварини утворюють гібриди.
Складною проблемою є визначення виду бактерій як розрізнити, чи є вони незалежними еволюційними одиницями, чи це сітчасті еволюційні одиниці. У першому випадку властивість передається вертикально в результаті подвійного поділу і клонального розширення.
Рослини можна регулярно маніпулювати для розмноження між традиційними групами видів, а різноманітні організми можуть обмінюватися генетичним матеріалом без розмноження взагалі. Гібридизація та безліч інших питань, які підривають концепцію виду, широко називаються проблемою виду.